После падения на Землю метеора, в воцарившемся хаосе мальчика по имени Тэцуро Дайба, чьи родители погибли во время этой катастрофы, навещает таинственная женщина по имени Мелло. Все тонет в ярком свете... Тэцуро приходит в себя уже на борту космического корабля, под наблюдением. Украв истребитель, который он даже не знает,как пилотировать, мальчик ускользает от похитителей.
Он оказывается в состоянии вспомнить, как пилотировать истребитель, благодаря памяти своего ДНК. Чтобы узнать больше, его друг доктор ведет Тэцуро в свою секретную лабораторию, но внезапно на лабораторию нападают вооруженные силы пришедшего к власти на Земле режима. Но все эти войска оказываются побеждены девочкой по имени Рей Юки, уничтожевшей их с помощью одного только реактивного истребителя! Очевидно, у нее, как и у Тэцуо, есть какие-то таинственные силы, которые, возможно, связаны с тем, что они были двумя единственными выжившими после падения метеора.
В поисках третьего выжившего (на поверку оказавшегося кошкой) они попадают в плен к королеве Фотон, правительнице захватившего власть на Земле предательского режима. Она утверждает, что она здесь, чтобы спасти Землю от тех, кто послал метеор. Наши герои оказываются перед выбором: кому верить - королеве или Мелло?