Нет более страшного врага, чем скука. Поэтому как только Кеичи за дверь, так три богини начинают развлекаться как могут. Главных условий два - маленький рост и как можно больше навредить лучшему другу, беззащитной крысе Ган-чану. А он и не против, потому что всё это безумно весело, что и делает Мини Богинь самым смешным аниме. Они дурачатся, разыгрывают сценки из фильмов и мультфильмов, устраивают полеты в космос, выборы президента, личную жизнь Ган-чана и многое многое другое.