Второй сезон считается несколько более серьёзным, чем первый, в нём Дзюн играет в значительной мере вспомогательную роль. В сюжет вводится новая Розен Мэйден — Канария (Кана Рейка), кроме этого появляется Барасуйсё и воскрешённая Розеном Суйгинто. Семь кукол, созданных Отцом- кукольным мастером Розеном, путешествующим во времене и чтимый своими творениями - пробудились.
Наделенные качествами идеала- Алисы - но имеющие изъяны, все они жаждут совершенства, к которому стремился их создатель, но так и не смог воплотить ни в одной из них. Барасуйсё, новоявленная седьмая кукла Розен Мейден, готова начать Игру Алисы, желая стать лучшей, совершенной, поглотив Мистические Розы -магическую силу, оживившую кукол - других. На фоне этих событий Синку понимает порочность сражений со своими сёстрами во имя создания Алисы. Но Игра начата, и придется сражаться, чтобы защитить свою жиснь и жизнь сестер.