Юки Нагато. Единственная, кто оказалась в «Команде SOS» не по инициативе Харухи. Юки Нагато была участником литературного кружка, но перешла в команду Судзумии вместе со своей комнатой, которую та отобрала у литературного кружка. Юки всегда невозмутима, спокойна, не проявляет никаких эмоций и, похоже, вообще избегает разговоров - хотя и даёт прямые короткие ответы, когда её спрашивают. Кроме любви к чтению и учёбе, её отличает талант работы с компьютерами, которая доставляет ей настоящее удовольствие. Беспрекословно исполняет приказы Судзумии, как бы глупы они ни были.
На самом деле, Юки не человек, а «человекоподобный интерфейс», присланный на Землю Межгалактическим Сообществом Объединенных Организованных Информационных Мыслесущностей (МСООИМ/ООИМ) для расследования причины невероятно большого, по их меркам, «информационного взрыва», произошедшего здесь три года назад и исследования способностей Харухи. Юки способна манипулировать потоками данных Вселенной, что на практике даёт ей возможность вносить некоторые модификации в окружающий мир. Практическое применение её способностей так или иначе связано с техникой. Так, в книгах её заклинания являются SQL запросами, а «излечение» Асахины от стрельбы лазером из глаз Юки производит, вводя в её кровь нанороботов, посредством укуса. Cо стороны же может казаться, что она пользуется магией. Обычно носила очки, но перестала после того, как Кён сказал, что без очков она выглядит симпатичней.
В «Исчезновении Харухи Судзумии» Юки успешно украла силы Харухи и изменила воспоминания людей (в том числе и Судзумии) за последний год по своему вкусу, оставив, однако, последнее слово за Кёном (он мог либо принять новый мир, либо отменить его), что говорит о том, что Юки более могущественна, чем Харухи. Также, в этой книге она единственная, чей характер изменился. Она по-прежнему молчалива и замкнута, но пытается сблизиться с Кёном, приглашая его к себе домой и пытаясь записать в свой кружок.
Anime News Network отмечает её сходство с персонажем аниме-сериала «Евангелион», Рей Аянами.