Тишина и спокойствие. Мир дышит свежим воздухом, никаких войн. Всё спокойно. Но однажды, Лайт и Рокмен смотрят телевизор, где видят, что на город опять напали Робот Мастеры. И самое странное... Это роботы др. Лайта. Затем по телеку показывается Вайли, и утверждает, что это др. Лайт хочет захватить мир. Причём Лайт якобы пытался уговорить Вайли, чтоб вместе править миром, но последний отказался. И затем показывается его счёт на швейцарском банке, мол, чтобы построить роботов для противодействия Лайтовым, ему нужны деньги. Затем все названивают Лайту... а Рокмен решается исправить всё.
Уязвимости боссов
Concrete Man —> Galaxy Man —> Jewel Man —> Plug Man —> Tornado Man —> Magma Man —> Hornet Man —> Splash Woman —> Concrete Man
Spike Shooters - Mega Buster
Shark Submarine (Первая Форма) - Splash Woman
Shark Submarine (Вторая Форма) - Tornado Man
Shark Submarine (Третья Форма) - Splash Woman
Twin Devil - Galaxy Man
Wily Machine IX (Первая форма) - Mega Buster
Wily Machine IX (Вторая Форма) - Concrete Man
Wily Capsule VII - Plug Man
Спец. Возможности
Rush Coil - старая добрая пружина. Имеется в самом начале игры.
Rush Jet - не отличается по действиям от RM4. Добывается после прохождения пяти робот мастеров.
Eddie - Выбрасывает Рокмену рандомную вещь. Стоит 50 болтов в магазине.
Beat - на этот раз птичка не клюёт врагов, а спасает РМ из ямы. Покупается в магазине за 50 болтов.