Полярные вершины уже давно растаяли и все континенты объединились в один огромный океан. Однако, Twin Town продолжает жить своей жизнью и всё в ней подчинено власти всемогущего Wong'а. Всё общество разделено на две части: пловцы, живущие в лодках под городом, с одной стороны и, с другой стороны, "нормальные" люди, живущие в городе, но в данный момент оказавшиеся в психиатрическом санитариуме...
Действие второй части игры происходит в 2145 году, через год после событий первой части. После уничтожения кометы и спасения Джейка и Тары Элвисом каждый отстаивал свою собственную жизнь. Месть Wong'а неизбежна! И несмотря на все усилия, приложенные Джейком к расследованию, похоже, операция "Дни Забвения" никогда не будет закончена и ближайшие друзья Wong'а, однажды исчезнувшие, возвращаются...