Спойлеры, спойлеры, спойлеры! Прочтение данного раздела ДО прохождения самой игры не рекомендуется!
Автор сценария: Ричард Морган, написавший также сюжет Crysis 2.
Однако, у большинства игроков остаются вопросы о сюжете. Происходит это прежде всего из-за отсутствия в игре русской озвучки. Есть только английская с не самыми удобочитаемыми субтитрами. Кроме того, львиная доля информации находится в текстовой версии - "инфобанке". Но в шутеры ведь играют не затем, чтобы что-то читать, верно?
В не очень далеком будущем правительства современных стран потеряли над ними контроль и уступили его "Синдикатам" - крупным технологическим корпорациям. Они делят между собой весь земной шар, содержат армию и соревнуются между собой в технологическом превосходстве. При этом мирное население вынуждено принять в себя чип, который вживляется в мозг. Это и паспорт, и деньги. Только с чипом можно получить жилье, работу, транспорт (кстати, летающий) и посещать развлекательные заведения. Однако плата за это - тотальный контроль. Повсюду, даже в квартирах, установлены камеры наблюдения и микрофоны. Однако, большинство жителей планеты всё же подвергаются чипированию и вверяют себя в руки одного из Синдикатов.
Игра начинается при тестировании чипа и "агента Кило", как теперь называют нашего героя. Неизвестно, что наплели солдатам, но они пытаются убить Кило, хотя их возможности заведомо ниже и шансы на выживание близки к нулю. Чип даёт Кило ускоренную реакцию, силу и нечеловеческую стойкость к ранениям. По ходу игры вы встретите совсем немного других агентов, большая часть противников обладает слабыми чипами. Вероятно, новейшие модели дороги в изготовлении.
После прохождения испытаний, Кило и агента Мерита отправляют в корпорацию Аспари, добыть чип Гэри Чана. Этот синдикат базируется в Лос-Анджелесе, поэтому на протяжении четырех этапов действие проходит именно там. Кило и Мерит врываются на базу Аспари и выполняют поставленную задачу. Остается только выбраться из растревоженного улья. Есть мнение, что эта операция была специально подстроена, чтобы развязать войну синдикатов.
Затем Джек Денэм посвящает Кило в подозрения о преданности Лили Дрол. Следующее задание связано со слежкой за ней в её же квартире. Лили крайне ценный сотрудник, и пускать в расход из-за простых подозрений её нельзя, однако и отдавать другому синдикату - никак нельзя. Судя по разговору по телефону, завербовать Лили действительно пытались. Но это был человек не из Аспари, и не из Кайман Глобал. Это Крис Дилейни, которого вы позже убьете, лидер какого-то сопротивления синдикатам (этот момент освящен слабо). А сейчас за Лили приходит отряд из Кайман Глобал. Не менее жестокий синдикат, чем ЕвроКорп. Они убивают гражданских без разбору. Они оглушают Лили и перевозят на свою плавучую базу в Северном Атлантическом океане. Кило вынужден отправиться следом, взломав (или просто забравшись на него? не факт) один из летательных аппаратов Кайман Глобал. На базу похитители и Кило прибывают почти одновременно. Агент пробивается к месту посадки транспорта похитителей. К тому времени Лили уже сбегает. Или её отпускают? Какое-то время кажется, что героя просто заманили на базу Кайман Глобал, но случившееся далее отметает эти сомнения.
Лили Дрол похищает тот же транспорт, на котором её привезли сюда и переносит героя в Нью-Йорк. А вот здесь всё очевидно. Лили связывается со своими знакомыми и натравливает на Кило целую армию. Возможно, потому что она не уверена, что Кило просто не убьет её, когда узнает, что она предала ЕвроКорп и собирается присоединиться к сопротивлению. Таким образом на Кило наваливаются противники с древним (из двадцатого века) оружием. Но при этом чипированные - их можно взламывать. Значит, они принадлежат к одному из синдикатов. Или принадлежали. В конце Кило убивает Криса, их лидера. Затем Кило может попытаться убить Лили. Ключевое слово - "может". А может вообще ничего не делать. Финал один, но мораль разная.
Здесь выясняется особенность чипа Кило - именно человек решает, что делать, чип лишь советует. В отличие от других агентов, Кило сохраняет наибольшую человечность. Это доказывает и взлом чипов других людей - в этом случае тело жертв вообще не слушается мозга, а выполняет прямые приказы чипа.
Эта особенность Dart 6.1 становится известной Джеку Денэму. Он решает убить Кило, или сделать что-то еще, этого мы уже не узнаем. Ведь зачем ему агент с супер сильным чипом, который его не слушается? Единственный выход для нашего героя - спастись самому, сбежав из ЕвроКорп. По пути он также освобождает Лили. Есть мнение, что между ними разгораются чувства. При этом сама Лили хочет отомстить Джеку Денэму "за всё". Она лжет Кило, что тот может просто убить его с помощью механизма самоуничтожения чипа. И единственный выход - успеть убить Джека до того. Одновременно с этим на Еврокора нападают сразу и Аспари, растревоженные нападение двух агентов на свой штаб, и Кайман Глобал, у которых примерно те же мотивы.
В финале ЕвроКорп уничтожен, или "почти" уничтожен. Он остался без босса и основной базы.
Кайман Глобал и Аспари наверняка также начали войну, ведь их люди убивали друг друга на базе ЕвроКорпа. Хотя это под вопросом.
Майлз Кило и Лили Дрол не принадлежат синдикатам, они могут идти куда угодно. Ждем следующей части!