Главным героем остался Айзек Кларк- известный нам еще из первой части. Айзек по профессии обычный инженер, который работает в С.Е.С- компании, которая управляет гигантскими бурильными станциями по всей галактике. На "Ишимуру" (станция по переработке «мёртвых планет» и извлечения ценной руды, место действия первой части)попадает добровольно. После пережитых событий на корабле часто имеет психическое расстройство.